En mars 2007, en même temps que le lancement européen de la console, Sony et l'université de Stanford intégraient un client Folding@Home dans la console PlayStation 3. Ce programme est un projet de calcul réparti qui a pour but d’étudier le comportement des protéines dans diverses configurations, et le processeur Cell de la console — surtout ses 7 SPE — est très efficace dans ce domaine.
Mais en novembre 2012, avec la mise à jour 4.30 de la console, Sony va supprimer Folding@Home de la console. Les raisons ne sont pas connues, mais l'université de Stanford indique que le projet — qui tourne sur d'autres plateformes — a permis notamment des avancées dans le domaine de la recherche sur la maladie d'Alzheimer.
Environ 15 millions de personnes — soit pas loin d'un utilisateur de la console sur quatre — auraient participé au projet, avec 100 millions d'heures de calcul au total. De plus, les travaux sur le client destiné à la console ont permis de mettre au point les clients pour les cartes graphiques, en mode GPGPU.